西南醫科大學中醫學和中西醫臨床醫學這兩個專業在培養目標、課程設置、教學方法和實踐能力培養等方面存在一定的區別：

1.培養目標：

-中醫學：主要培養具有中醫藥理論知識和實踐技能，能在中醫領域從事醫療、預防、保健、康復、教育、科研等工作的中醫專門人才。

-中西醫臨床醫學：培養的是既掌握中醫藥理論知識和實踐技能，又具備現代醫學基礎理論和臨床技能的復合型人才，能在中西醫相結合的領域從事醫療、預防、保健等工作。

2.課程設置：

-中醫學：課程主要包括中醫基礎理論、中醫診斷學、中藥學、方劑學、中醫內科學、中醫外科學等。

-中西醫臨床醫學：除了上述中醫課程外，還包括西醫基礎課程如解剖學、生理學、病理學、藥理學、診斷學、內科學、外科學等。

3.教學方法：

-中醫學：注重中醫理論的學習和中醫臨床技能的培養，如針灸、推拿、中草藥等。

-中西醫臨床醫學：強調中西醫結合，在中醫理論的基礎上，也重視西醫理論的學習和實踐技能的培養。

4.實踐能力培養：

-中醫學：重點在于中醫臨床技能的培養，如針灸、推拿、中草藥的應用等。

-中西醫臨床醫學：注重中西醫兩種醫學技能的綜合運用，旨在培養能夠在實際工作中靈活運用中西醫知識解決臨床問題的能力。

中醫學專業更側重于中醫理論和技能的培養，而中西醫臨床醫學專業則更加注重中西醫知識的融合，培養的是能夠綜合運用兩種醫學知識的人才。