連云港航海職業技術學院并非本科院校，而是專科院校，依據如下：

• 學校歷史沿革與定位：搜索結果中未查詢到名為“連云港航海職業技術學院”的相關內容，但有連云港職業技術學院的相關信息。連云港職業技術學院的前身是連云港市職工大學，1979年開始舉辦國民專科學歷教育；1983年3月，成立連云港職業大學；1999年3月，連云港職業大學與連云港市職教中心合并，更名為連云港職業技術學院，其定位為專科院校，未涉及本科教育相關信息，由此推測不存在名為“連云港航海職業技術學院”的本科院校，可能是混淆了名稱或者不存在這一本科院校名稱的實體。
• 教育體系劃分慣例：在我國教育體系中，高校明確劃分為本科和專科兩個層次，若存在名為“連云港航海職業技術學院”的學校，從“職業技術學院”這一名稱來看，通常屬于專科層次院校，因為本科院校名稱一般為大學或者學院，較少以“職業技術學院”命名（當然存在少數本科職業大學，但從目前情況看，沒有名為連云港航海職業技術學院的本科職業大學）。

綜上所述，沒有證據表明存在名為“連云港航海職業技術學院”的本科院校，它極有可能不是本科院校。