如果你的U盤里有一個名為“MyDocuments”的文件夾，在初始化（格式化）后仍然存在，這可能是由以下幾個原因造成的：

1. 格式化不完全：初始化過程中如果出現中斷或者格式化命令沒有正確執行，可能會導致部分文件或文件夾沒有被清除。

2. 系統保留：某些文件或文件夾可能被系統保留，不會在常規的格式化過程中被刪除。

3. 隱藏文件：可能該文件夾被設置為隱藏，導致在初始化時沒有被發現。

4. 第三方軟件影響：某些第三方軟件可能會在U盤上創建文件或文件夾，并在初始化時未被刪除。

以下是一些可能的解決方法：

重新格式化：嘗試使用不同的格式化工具重新格式化U盤，確保格式化過程完整無誤。

檢查隱藏文件：在U盤上檢查是否有隱藏文件夾或文件，并將其刪除。

使用安全模式：在安全模式下格式化U盤，有時候可以解決常規模式下無法刪除的問題。

使用命令行：在命令行中使用`format`命令來格式化U盤，確保使用正確的參數。

第三方工具：使用一些專業的數據恢復或清理工具來幫助刪除頑固的文件或文件夾。

在進行任何操作之前，請確保備份重要的數據，以免數據丟失。如果問題仍然存在，可能需要尋求專業的技術支持。